Las líneas programáticas representan los abordajes claves que realiza la institución, desde una lectura del estado de situación de la promoción, el ejercicio, y la defensa de los derechos de los niños, niñas, adolescentes y las mujeres adultas, atendiendo a los recursos a los que razonablemente puede acceder.
Cada línea programática establece un mandato particular, a partir del cual se pueden originar un conjunto de iniciativas institucionales vinculadas y delimitadas en su alcance a determinados derechos específicos.  Las líneas programáticas están encaminadas a permitirnos incidir positivamente en determinados aspectos del contexto, social, económico, cultural y político, que afectan la promoción, el ejercicio y la defensa de los derechos de los niños, niñas, adolescentes y de las mujeres adultas.

Las líneas programáticas son: